Небанковская кредитная организация-центральный контрагент "Национальный клиринговый центр" (далее - НКО НКЦ (АО)) направил запрос в ФНС России за разъяснением об отсутствии налоговых рисков по вычетам НДС у покупателей агропродукции, в частности зерна, на биржевых торгах с участием центрального контрагента (НКО НКЦ (АО)). МИ ФНС России по крупнейшим налогоплательщикам №9 по поручению ФНС России от 01.02.2018 №15-1-03/191@ дало соответствующее разъяснение, содержащее следующий вывод: "…сам по себе факт подтверждения через анализ встречных данных, в том числе по линии АСК-2 НДС, наличия прямых отношений по поставке товара покупателю в рамках биржевой торговли от НКО НКЦ (АО) позволяет не инициировать дальнейшее истребование документов-подтверждений совершения сделки между НКЦ и покупателем товара и принять заявленный покупателем по линии НКЦ вычет в полном объеме.". Исключение составляют случаи, когда налоговый орган "выявляет признаки/факты совершения покупателем товара (через НКЦ) противоправных деяний с использованием данного товара/товарной группы (либо противоправной деятельности как таковой)". Таким образом, данное разъяснение подтверждает факт отсутствия налоговых рисков у покупателей зерна на бирже по прямым сделкам по приобретению зерна в силу того, что зерно приобретается на анонимных торгах и продавцом для всех покупателей является НКО НКЦ (АО) – центральный контрагент.
 
Следующим шагом Группы "Московская Биржа" является выработка и согласование с ведомствами (ФНС России, ФАС России, Минсельхозом России и Банком России) системы мер по минимизации рисков самого НКО НКЦ (АО), которые возникают у него в связи выполнением функции центрального контрагента по отношению к продавцам зерна на бирже (НКЦ покупатель зерна по всем биржевым сделкам). Данные меры призваны ограничить доступ на биржевые торги недобросовестных продавцов с целью исключить претензии налоговых органов к НКО НКЦ (АО) по вычетам НДС по биржевым сделкам. При этом продавцы, как сельхозтоваропроизводители, так и трейдеры и элеваторы, не имеющие признаков недобросовестности (по методике должной осмотрительности, рекомендованной ФНС России) смогут осуществлять реализацию зерна на биржевых торгах.